Η μεθυλίωση του DNA (DNAme) αποτελεί έναν από τους σημαντικότερους επιγενετικούς μηχανισμούς, με καθοριστικό ρόλο στη διαφοροποίηση των ιστών και τεκμηριωμένη συσχέτιση με παθήσεις όπως ο καρκίνος και οι μεταβολικές διαταραχές. Παρά την ανάπτυξη προηγμένων πλατφορμών μικροσυστοιχιών, η ανάλυση των σχετικών δεδομένων παραμένει σύνθετη και απαιτεί εξειδικευμένες βιοπληροφορικές γνώσεις. Για την αντιμετώπιση αυτών των προκλήσεων αναπτύχθηκε η διαδικτυακή εφαρμογή CpGene, μια φιλική προς τον χρήστη πλατφόρμα για την ανάλυση και οπτικοποίηση δεδομένων μεθυλίωσης DNA. Το CpGene υποστηρίζει τις μικροσυστοιχίες Illumina 450K, Illumina EPIC και Illumina EPICv2, επεξεργαζόμενο αρχεία .idat με ενσωματωμένες λειτουργίες προεπεξεργασίας, κανονικοποίησης και ελέγχου ποιότητας. Παρέχει δυνατότητες ανακάλυψης βιοδεικτών μέσω ανάλυσης διαφορικής μεθυλίωσης, τεχνικών μηχανικής μάθησης και ανάλυσης εμπλουτισμού γονιδίων. Μέσα από ενοποιημένη διεπαφή και σαφείς οπτικοποιήσεις, διευκολύνει τον εντοπισμό CpG θέσεων και γονιδίων με βιολογική και κλινική σημασία.